[校内分散采购（用户自购）]hic互作数据采集和分析测试采购结果公告
· 2022-09-05
服务类项目采购公示表
采购计划单号：SQ22080989
| 公示项目名称 | HiC互作数据采集和分析测试 | ||
| 用户单位名称 | 生命科学学院 | 联系人/电话 | 赵**/137****4791 |
| 采购计划预算 | 转/零A463水稻高产优质关键性状的分子机理 | 经费卡号 | 4600-E19203 |
| 项目需求 | 对1个水稻（基因组大小预估400Mb，染色体数量2n=24）的组织样品进行高通量染色体构像捕获（Hi-C），采用BGI测序平台（PE150模式）完成DNA互作信息采集。每个样品构建1个Hi-C文库，每个Hi-C文库测序120Gb，即每个样本的总测序量为120Gb Raw data（整体测序深度为300X，可上下浮动5Gb）。分辨率达到10kb，进行以下生物信息分析 | ||
| 预算测算依据 | 1.原始数据质控； 2.数据产出统计； 3.将数据迭代比对到参考基因组并进行有效比对过滤； 4.构建互作矩阵并校正； 5. 分辨率评估； 6. 距离与互作强度关系分析； 1.Compartment结构分析； 1.1 Genomic compartment结构图 1.2 Genomic compartment数目及长度分布 1.3 Genomic compartment基因密度分布 1.4 Genomic compartment GC含量分布 2.Topologically associated domain (TAD) 结构分析； 2.1 TAD结构图 2.2 TAD的数目及长度分布 2.3 TAD基因密度分布 2.4 TAD GC含量分布 2.5 TAD的边界motif分析 3. 显著互作位点分析（Loops）； 4. FIRE(Frequently Interacting Regions)检测； 5. 样本间互作差异分析；（两个及以上的样本） 5.1 构建样本间差减矩阵 5.2样本间Compartment比较分析 5.3样本间TAD比较分析 5.4样本间显著性互作比较分析 | ||
| 推荐承办单位名单及承办价格 | 承办单位：武汉莎菲基因 承办价格：21,000元 | ||
| 备注 | |||
注：
1、任何单位或者个人对上述项目的预算、推荐承做单位等有异议的，可以在公示期内将书面意见反馈至监督单位。
2、根据政府采购实施条例第18条“单位负责人为同一人或者存在直接控股、管理关系的不同供应商，不得参加同一合同项下的政府采购活动”，报价单位之间不得是关联企业，报价单位需提供企业基础信息。企业基础信息不限于以下系统查询：
3、监督单位、电话：
华南农业大学采购招标中心，监督电话：020-85282580 传真：020-85282580
4、特殊服务类包括学术论文的发表、宣传服务、出版服务、测试服务、测序服务、仪器设备的维修服务（不含广东省财政厅公布的应定点采购的相关品目），同一预算年度内，同一预算项目下，年度累计预算未达到政府采购限额标准的。
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